《最后生还者》讲的是，现代文明完蛋20年后，因为一场传染病，人类快灭绝了，大家都在末日里挣扎求生。如果说第一季说的是联邦应急管理局（FEDRA）怎么把人圈在一个地方来救他们，那第二季就讲西雅图是怎么应对末日的。在《最后生还者》第二季里，有群人就在西雅图街头晃悠，他们要找艾比，还有杀了乔尔的凶手。观众们了解到华盛顿解放阵线（WLF）怎么占领西雅图的，同时这伙人也正跟一个说WLF是坏蛋的宗教团体打起来了。现在第二季第五集也播了，外媒Gamerant详细回顾了这集的剧情。
【以下内容涉及剧透】
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本集开头，汉娜兰（Hanharan）去查看点啥，然后走进一个全是士兵的大厅。她看到地下室的门被锁上了，门闩是从地面上插死的。她离开大厅，进了一间小屋，帕克中士正等着她，问地下室出了啥大事。汉娜兰问她发生了啥，为啥死了这么多士兵。
帕克说，她和她的团队负责守医院，他们把一楼到六楼的人都清出去了，期间干掉了一些感染者。之后，他们转移到地下室（B1、B2和B3）。她还指出，2003年第一批得冬虫夏草的人，就是被送这里的。但这些楼层不好进，帕克派了一队人，走一个还能用没塌的楼梯进了地下室。
这队人搜了B1和B2。在B2，他们在墙壁和地板上看到了虫草。他们知道B3肯定也有感染者，但还是去搜了最下面一层。五分钟后，队里的里昂通过无线电告诉帕克，空气里全是感染的味道，想把队伍关在地下室里。帕克说，她知道感染不在通风口里，因为要在的话，现在大家早都被感染了。结果，他们把B1和B2的唯一入口锁上了。汉娜兰告诉帕克，她处理得挺勇敢，还为她死了这么多士兵道歉。最后真相揭开，里昂是帕克中士的儿子。
与此同时，迪娜正打听WLF士兵在哪儿，这样他们就能找到去医院的路，找到杀了乔尔的凶手。就在被感染者伏击前，迪娜和艾莉抢到了WLF用的一部对讲机。迪娜正用那部对讲机找他们的老巢。艾莉觉得WLF老公开说自己在哪儿、要干嘛，也太不小心了吧。不过迪娜说，他们这么公开说，主要是因为他们正跟一个不用这些高科技的敌人打。她指的是“疤脸帮”。
他们开始商量怎么去医院大楼，找到艾比和她的团队。黛娜告诉艾莉，WLF士兵从北向南巡逻，但有个地方他们不去。艾莉反应过来，WLF因为感染者的存在不敢靠近那栋楼。要是他们能穿过那个区域和那栋楼，就能到医院，在一楼能找到诺拉（塔蒂·加布里埃尔饰）。艾莉和黛娜知道计划挺冒险的，但要想给乔尔报仇，就得这么干。路上，她们看到几具“疤脸帮”的尸体，艾莉有点紧张。
黛娜没停，反而告诉艾莉她杀的第一个人。当时她八岁，因为世界末日，她妈从不让她出去玩。但有一天，她还是带着枪出去了。等她回来，一个袭击者杀了她妈和妹妹，她当时还在屋里。八岁的黛娜杀了那个袭击者。黛娜明确说，要是那天她没杀袭击者，她会一直追杀他。黛娜说完还说，艾莉可以走，也可以继续追杀她。要是她死了，怪她自己，不怪艾莉。艾莉后来同意继续追杀。
艾莉和黛娜打算晚上偷偷溜进大楼。一进门，黛娜说计划是动刀子，情况不对就跑，然后坦白她爱艾莉。艾莉同意了，她们进了大厅。看到一个感染者想处理时，情况更糟了。她们看到的感染者和艾莉在杰克逊遇到的很像，一个更聪明、更会骗人的。
她们发现大厅里好几个感染者，得想办法。艾莉告诉黛娜，她会把感染者引到自己身边，黛娜该跑到最近的门边把自己锁起来。起初艾莉和黛娜觉得能跑掉，但感染者占了上风，看起来可能会有人受伤。好在有人来救她们。
过会儿真相大白，是杰西救了她们，把她们从楼里带了出来。几个WLF士兵想杀她们，但三人进了一个WLF士兵没去过的公园。艾莉问杰西是不是一个人，杰西说汤米和他在一起，于是他们决定分头行动。穿过公园时，她们撞见“疤脸帮”正在残忍杀一个WLF士兵。最后她们被发现了，黛娜被箭射中。艾莉 again 把敌人引到自己身边，藏到一棵树里。与此同时，杰西带着黛娜去了之前艾莉和黛娜待过的剧院。艾莉从树上下来，发现自己离湖山医院很近。她二话没说就进了医院，没告诉黛娜。
后来艾莉走进医院大楼，找到了诺拉。诺拉想激怒艾莉，她说乔尔是当着她的面被杀的，乔尔活该被这么残忍地杀。她跑掉了，还让几个WLF士兵去杀艾莉，但没成功，艾莉跟着诺拉到了地下室。
艾莉一进地下室，就看到虫草菌感染满墙满地。她看着被虫草菌盖着的人粘在墙上，其中一个人正在呼孢子。艾莉发现诺拉倒在地上，诺拉告诉艾莉，这些人正在吸孢子，几分钟后就会死。艾莉好像不在乎，诺拉这才反应过来艾莉对这种感染免疫。她告诉艾莉，乔尔杀了那个可能发明解药的人：艾比的父亲。
本集结尾，艾莉问诺拉艾比在哪儿。诺拉不肯说，艾莉就用金属棒打了她好几次。黑屏后，观众看到艾莉从睡梦中醒来，乔尔站在她面前。